Hatte ich damals mit meinem manchmal auch. Gründe waren zunächst nicht ersichtlich. Wenn es die Batterie wäre würde das "Orgeln" ja recht zäh verlaufen, das war es aber nicht. Der Anlasser dreht kräftig durch, aber er wollte einfach nicht anspringen.
Wir hatten hier mal im Forum die Vermutung, dass die Elektronik den Zündschlüssen nicht gleich erkannte, nämlich immer dann, wenn der Zündschlüssel mehr oder weniger nach den Reinstecken in's Zündschloss sofort zum Starten gedreht wurde. Es soll die Zeit zum Datenabgleich nicht ausgereicht haben. Oft half, den Schlüssel wieder raus zu nehmen, neu einzustecken, etwas warten und dann starten. Kannst ja mal probieren.
Nächste These: wenn man zum Ausschalten des Motors noch mal auf's Gas tritt, wie es früher bei Vergaserautos üblich war, da kann mitunter unverbrannter Diesel im Brennraum zurück bleiben...sprich wie "Abgesoffen", dann dauert der Startvorgang auch länger.
Aber wie gesagt, alles Vermutungen. Das Prozedere mit dem Schlüssel scheint mir noch am Logischten, da ich es selbst mal ausprobiert hatte, wenn er nicht gleich anspringen wollte, es half.
Good Luck